Clique no botão Add File(s) ou clique no menu File e depois em Add File(s).
Selecione o arquivo que deseja converter.
Ele aparecerá no painel central.
Dê um clique sobre ele.
Clique no botão 
para escolher o diretório em que o arquivo convertido será salvo (Output Folder).
Em Output Format selecione o formato que irá converter seu arquivo.
Os formatos suportados são estes abaixo:
.aac, .aiff, .aif, .amr, .ape, .au, .flac, .gsm, .m3u, .m4a, .mp3, .mpc, .oog, .pls, .raw, .rss, .spx, .vox, .wav, .wma, .wpl, .spx
Após tudo pronto, clique no botão no lado inferior direito, e aguarde a conversão ser finalizada!
É bem rápido.